کمک هوش مصنوعی به توسعه ژن و سلول درمانی

چگونه WhiteLab Genomics از هوش مصنوعی برای کمک به توسعه ژن و سلول درمانی استفاده می کند

کمک هوش مصنوعی به توسعه ژن و سلول درمانی ، شرکت بیوتکنولوژی فرانسوی WhiteLab Genomics ده میلیون دلار بودجه برای پلتفرم هوش مصنوعی که برای کمک به کشف و توسعه درمان‌های ژنومی طراحی شده است، جمع‌آوری کرده است.WhiteLab Genomics نتیجه ی تلاش یکی از فارغ‌التحصیل اخیر Y Combinator (YC) است که در سال 2019 در پاریس تأسیس شد، شبیه‌سازی‌های نرم‌افزاری پیش‌بینی‌کننده را به شرکت‌های ژن درمانی و سلول‌درمانی ارائه می‌کند تا طراحی ژن و درمان‌های سلولی را تسریع بخشد. ژن درمانی، برای افراد ناآشنا، یک درمان نوظهور است که شامل جایگزینی ژن های از دست رفته یا معیوب در سلول ها برای اصلاح اختلالات ژنتیکی است، در حالی که سلول درمانی تغییر یک سلول یا مجموعه ای از سلول ها برای ایجاد یک اثر در سراسر بدن است. هزاران بیماری از جمله فیبروز کیستیک، پارکینسون و آلزایمر ناشی از نقص در DNA افراد و تحقیقات نوظهور در درمان ژنی و سلولی ممکن است در نهایت چنین شرایطی را در منبع خود درمان کنند و نیاز به دارو یا جراحی را جایگزین کنند.
با این حال، توسعه چنین درمان هایی معمولاً پرهزینه است، بدون اینکه تضمینی برای کارآمدی آنها وجود داشته باشد. به گفته دیوید دل بورگو، مدیر عامل و بنیانگذار WhiteLab Genomics، روش‌های کنونی در توسعه ژن‌ها و درمان‌های سلولی جدید معمولاً شامل یک رویکرد آزمون و خطا است که به موجب آن دانشمندان یک فرضیه علمی می‌سازند و آن را در آزمایشگاه آزمایش می‌کنند: اگر موفقیت آمیز باشد، پیشرفت می‌کند. مرحله بعدی، اما اگر ناموفق بود، با فرضیه دیگری به نقطه اول برمی‌گردند. و اینجاست که WhiteLab Genomics با یک رویکرد محاسباتی که یادگیری ماشین و تکنیک های یادگیری عمیق را برای پردازش چندین فرضیه علمی به طور همزمان و بررسی انواع مختلف ژنتیکی “برای پیش بینی بهترین طرح مولکولی برای درمان” بر اساس اهداف، ترکیب می کند، وارد معرکه می شود. دل بورگو به TechCrunch توضیح داد: «درمان‌های ژنی و سلولی هنوز از اثربخشی ضعیف، اثرات ثانویه ایمنی و هزینه توسعه بسیار بالا رنج می‌برند. ما مدل‌های پیش‌بینی جامعی را به مشتریان ارائه می‌دهیم که ژنتیک و زیست‌شناسی محاسباتی را با هم ترکیب می‌کنند تا کاندیداهای برتر را برای آزمایش در آزمایشگاه طراحی و انتخاب کنند.»

داده ها را به من نشان بده

همانند تقریباً هر مدل هوش مصنوعی، WhiteLab Genomics از مجموعه‌های داده بی‌شماری برای آموزش الگوریتم‌های خود در مخازن ژنومی، RNA، انکولوژیک و پروتئین، علاوه بر «مجموعه‌ای جامع از اسناد» مانند داده‌های تحقیقات علمی و بالینی عمومی استفاده می‌کند. دل بورگو افزود: «ما همچنین با مؤسسات تخصصی برای غنی‌سازی مدل‌ها با داده‌های غیرعمومی اضافی نیز همکاری می‌کنیم». “ما الگوریتم‌های خود را بر روی مجموعه‌های داده با مشخصه‌هایی که در پایگاه داده گراف دانش ما به هم مرتبط هستند آموزش می‌دهیم و اعتبارسنجی می‌کنیم. اینها شامل پایگاه‌های داده عمومی، داده‌های اختصاصی و مجموعه داده‌های شرکای ما می‌شود. این الگوریتم‌ها ویژگی‌های بیولوژیکی را از توالی‌های ژنتیکی جدید برای ساخت بردارهای درمانی جدید پیش‌بینی می‌کند و جدید تولید می‌کند که به ان سازه های درمانی می گویند.”
از نظر انواع درمان هایی که WhiteLab Genomics به توسعه کمک می کند، دل بورگو گفت که این شرکت در حال حاضر روی پروژه هایی از جمله درمان های مبتنی بر DNA برای شرایط متابولیک مانند بیماری های لیزوزومی و همچنین درمان های بنیادی سلولی برای بیماری های خونی مانند داسی کار می کند. بیماری های سلولی و درمان های ژن ایمنی برای درمان سرطان ها نیز از گونه مباحث و پروژه هایی هست که بر روی انها تحقیقات انجام می شود. در جاهای دیگر، تعدادی از شرکت‌ها از هوش مصنوعی برای کمک به کشف دارو استفاده می‌کنند، مانند BenevolentAI که سرمایه‌گذاری قابل توجهی را از دنیای VC جمع‌آوری کرده است، در حالی که Cellino برنده Startup Battlefield از TechCrunch اخیراً 80 میلیون دلار برای توسعه سلول‌درمانی با استفاده از هوش مصنوعی سرمایه جمع‌آوری کرده است. WhiteLab Genomics مشابه است، اما هم با شرکت های ژن و هم با شرکت های سلول درمانی کار می کند. همچنین شایان ذکر است که WhiteLab Genomics فهرست رو به رشدی از استارت آپ های فرانسوی را برای نفوذ موفقیت آمیز به رتبه های YC نشان می دهد. از 40 شرکت اروپایی در گروه Winter ’22 WhiteLab Genomics، 5 شرکت فرانسوی بودند، رقم برای دوره تابستانی 22 به 8 افزایش یافت. WhiteLab Genomics با 10 میلیون دلار در بانک از طرف سرمایه‌گذار فرانسوی Omnes Capital و Debiopharm سنگین وزن بیودارویی، اکنون از بودجه خوبی برخوردار است تا پلتفرم خود را ایجاد کند و مشارکت‌های خود را با حوزه علمی دو برابر کند، که تاکنون شامل همکاری‌های قابل توجه با فرانسوی‌ها بوده است.

تالیف:
فروشگاه اینترنتی آ.اس.پ (اقتباس از مقاله‌ای از TechCrunch)
در صورت استفاده از این مقاله، نام و آدرس فروشگاه اینترنتی آ.اس.پ را به عنوان منبع ذکر کنید.